全聘课题组长
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  • 陈飞

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工作经历
青年研究员 复旦大学,生物医学研究院(2019.12-至今)
博士后 美国斯隆凯特琳癌症中心 (2018.3-2019.11)
教育经历
博士 美国西北大学 生物化学与分子遗传系(2018)
硕士 复旦大学 生命科学学院(2012)
学士 山东大学 生命科学学院 (2005)

所获人才项目
上海高校特聘教授(2019)
所获奖项
西北大学医学院优秀毕业生(Driskill Award)(2018)
国家优秀自费留学生奖学金特别优秀奖(2016)
教育部自然科学一等奖(第五完成人) (2016)
研究方向
主要研究方向是癌症表观遗传学。主要利用基因组学、生物信息学、遗传学和细胞分子生物学等前沿方法研究转录和表观遗传调控因子的调控机制及其在肿瘤发生、发展和转移过程中的功能,探索和鉴定新的分子治疗靶标和靶向治疗策略。目前,申请人成功揭示了新的转录调控和表观遗传调控机制,并建立了以病人肿瘤样本和小鼠为基础的类器官体模型和国际领先的测量表观遗传学信息的高通量测序方法,为将要开展的转录失调和表观遗传学变异在肿瘤中作用的研究打下了坚实的基础。
代表论文

1.Chen FX, Smith ER, Shilatifard A. Born to run: Control of RNA polymerase II transcription elongation. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2018 May 8. doi:10.1038/s41580-018-0010-5.

2.Chen FX, Xie P, Collings CK, Cao K, Marshall SA, Rendleman EJ, Ugarenko M, Zhang A, Shiekhattar R, Smith ER, Shiekhattar R, Zhang MQ, Shilatifard A. PAF1 regulation of promoter-proximal pause release via enhancer activation. Science. 2017 Sep 22;357(6357):1294-1298.

3.Chen FX, Woodfin AR, Gardini A, Rickels RA, Marshall SA, Smith ER, Shiekhattar R, Shilatifard A. PAF1, a molecular regulator of promoter-proximal pausing by RNA polymerase II. Cell. 2015 Aug;162(5):1003-1015.

4.Chen F, Gao X, Shilatifard A. Stably paused genes revealed through inhibition of transcription initiation by the TFIIH inhibitor triptolide. Genes & Development. 2015 Jan 1;29(1):39-47.

5.Chen F*, Yang H*, Dong Z*, Fang J, Wang P, Zhu T, Gong W, Fang R, Shi YG, Li Z#, Xu Y#. Structural insight into substrate recognition by histone demethylase LSD2/KDM1b. Cell Research. 2013 Feb;23(2):306.

6.Fang R*, Chen F*, Dong Z, Hu D, Barbera AJ, Clark EA, Fang J, Yang Y, Mei P, Rutenberg M, Li Z, Zhang Y, Xu Y, Yang H, Wang P, Simon MD, Zhou Q, Li J, Marynick MP, Li X, Lu H, Kaiser UB, Kingston RE, Xu Y#, Shi YG#. LSD2/KDM1B and its cofactor NPAC/GLYR1 endow a structural and molecular model for regulation of H3K4 demethylation. Molecular Cell. 2013 Feb 7;49(3):558-70.

7.Chen FX, Marshall SA, Deng Y, Tianjiao S. Measuring Nascent Transcripts by Nascent-seq. Methods in Molecular Biology. 2018;1712:19-26.

8.Huang YH, Hu J, Chen F, Lecomte N, Basnet H, David CJ, Witkin MD, Allen PJ, Leach SD, Hollmann TJ, Iacobuzio-Donahue CA, Massague J. ID1 mediates escape from TGF-β tumor suppression in pancreatic cancer. Cancer Discovery. 2019 Oct 3. pii: CD-19-0529.


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