千人计划
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  • 施扬

    博士,教授,博士生导师,复旦大学附属中山医院兼职教授
    地址:东安路131号,明道楼515室,上海200032
    电话:021-54237821(办公室),021-54237874(实验室)
    传真:021-54237821
    邮箱:yang_shi@hms.harvard.edu

工作经历
特聘教授,复旦大学,生物医学研究院(2007-至今)
Merton Bernfield新生儿科学讲席教授,波士顿儿童医院医学系(2009-至今)
教授,哈佛大学医学院,细胞生物学系(2009-至今)
教授,哈佛大学医学院,病理学系(2004-2011)
副教授,哈佛大学医学院,病理学系(1997-2004)
助理教授,哈佛大学医学院,病理学系(1993-1997)
助理教授,哈佛大学医学院,细胞与分子生理系(1991-1993)
博士后,美国普林斯顿大学(1988-1991)
教育经历
博士,美国纽约大学,分子生物学专业(1982-1987)
学士,上海医科大学,药学系(1978-1982)
所获人才项目
美国艺术与科学研究院,院士,2016
千人计划讲席教授(B类),中组部,2012
“长江学者”讲座教授,教育部,2005
AAAS Fellow,(American Association for the Advancement of Science),2011
所获奖项
1994-1997,Junior Faculty Research Award,American Cancer Society
2001–2002,Ludwig Scholar,Ludwig Institute for Cancer Research
2008,NIH Asian and Pacific Islander Month Lecture,NIH
2009,William Potter lecture,Thomas Jefferson University
2009,CBIS Senior Investigator Award,Chinese Biological Investigators Society
2012,Research Professorship,American Cancer Society
研究方向
施扬教授在基因表达调控和染色质修饰等生物学领域做出过大量重大发现。最重要的研究成果之一是发现了首个组蛋白赖氨酸去甲基化酶LSD1,结束了长达40多年关于组蛋白是否可以去甲基化的争议,开启了与人类健康疾病密切相关的组蛋白甲基化调控领域,该成果发表在2004年的Cell上。此后他的实验室还发现了大量JMJC类去甲基化酶。2015年,他的实验室首次在真核生物(线虫)中发现了一种全新的DNA修饰——m6A,作为完全未知的第9种DNA碱基,m6ADNA的功能亟待探索,同时提示我们,生物的遗传密码中还有很大的未知领域。在线虫中,他的实验室发现了组蛋白乙酰化酶CBP/p300在分化中起关键作用,揭示了细胞命运和组织分化过程中表现出了乙酰化和去乙酰化的动态双向调控关系;并参与发明了基于DNA载体的RNA干扰技术,该技术目前广泛应用于哺乳动物基因功能的相关研究中。到目前为止,仅RNAi 和 LSD1 两篇论文已经被引用超过4000次(Google Scholar数据)。施扬教授在组蛋白去甲基化方面的研究推动表观遗传学快速发展,深化人们对组蛋白甲基化修饰的认识,这些工作将对生物医药产生深远影响。此外,他还领导表观遗传制药先锋——星座制药企业,旨在通过精准调控基因表达,治疗人类疾病。施扬教授主要在表观遗传学领域开展研究。组蛋白修饰、DNA甲基化、RNA甲基化是表观遗传学领域的重要研究内容。组蛋白上存在着甲基化、乙酰化、泛素化、磷酸化等复杂修饰;DNA上存在着甲基化和羟甲基化修饰;RNA甲基化是转录后的表观修饰。这些修饰对基因的表达起到重要的调控作用,与细胞在特定条件下的表型密切相关。施扬教授目前的主要研究方向是阐明这些修饰的建立、去除和识别的分子机制,并揭示表观修饰与癌症等重大疾病的关系。
代表论文
  1. Ma C., Karwacki-Neisius V., Tang HR., Li WJ., Shi ZN., Hu HL., Xu WQ., Wang ZT., Kong LC., Lv RT., Fan Z., Zhou WH., Yang PY., Wu FZ., Diao JB., Tan L., Shi YG., Lan F+. , and Shi Y+. (2016). Nono, a Bivalent Domain Factor, Regulates Erk Signaling and Mouse Embryonic Stem Cell Pluripotency. Cell Rep 17, 997-1007. +co-corresponding.

  2. Shen HJ, Xu WQ, Guo R, Rong BW, Gu L, Wang ZT, He CX, Zheng LJ, Hu X, Shao ZM, Yang PY, Wu FZ, Shi GYJ, Shi Y*, and Lan F*. (2016). Suppression of Enhancer Overactivation by a RACK7-Histone Demethylase Complex. Cell 165, 331-342. (* Correspondence).

  3. Guo, R, Zheng, LJ, Park, JW, Xu, WQ, Chen, H, Qiu, JS, Lv RT, Wang, ZT, Yang, PY, Wu, FZ, Shi, XB, Fu, XD, Shi, GYJ, Xing, Y*, Lan, F*, and Shi, Y*. (2014). BS69/ZMYND11 Reads and Connects Histone H3.3 Lysine 36 Trimethylation-Decorated Chromatin to Regulated Pre-mRNA Processing. Mol Cell 56, 298-310. (* Correspondence).

  4. Ma H, Chen H, Guo X, Wang Z, Sowa ME, Zheng L, Hu S, Zeng P, Guo R, Diao J, Lan F, Harper JW, Shi YG, Xu Y, Shi Y. (2012). M phase phosphorylation of the epigenetic regulator UHRF1 regulates its physical association with the deubiquitylase USP7 and stability. Proc Natl Acad Sci U.S.A. 109, 4828-4833.

  5. Rajakumara E, Wang Z, Ma H, Hu L, Chen H, Lin Y, Guo R, Wu F, Li H, Lan F, Shi YG, Xu Y, Patel DJ, Shi Y. (2011). PHD finger recognition of unmodified histone H3R2 links UHRF1 to regulation of euchromatic gene expression. Mol Cell 43, 275-284.

  6. Xiang, Y*., Laurent, B*., Hsu, C-H*., Nachtergaele, S., Lu, ZK., Xu, CY., Sheng, WQ., Jian,OY., Wang, SQ., Ling, D., Hsu, P-H., Zou, L., Jambhekar, A., He, C., and Shi, Y. (2017). m6A RNA methylation regulates the UV-induced DNA damage response. Nature 543, 573-576. *Equal contributions.

  7. Greer EL, Blanco MA, Gu L, Sendinc E, Liu J, Aristizábal-Corrales D, Hsu CH, Aravind L, He C, Shi Y. (2015). DNA Methylation on N6-Adenine in C. elegans. Cell 161, 868-878.

  8. Laurent B, Ruitu L, Murn J, Hempel K, Ferrao R, Xiang Y, Liu S, Garcia BA, Wu H, Wu F, Steen H, Shi Y. (2015). A specific LSD1/KDM1A isoform regulates neuronal differentiation through H3K9 demethylation. Mol Cell 57, 957-970.

  9. Alpatov R, Lesch BJ, Nakamoto-Kinoshita M, Blanco A, Chen S, Stützer A, Armache KJ, Simon MD, Xu C, Ali M, Murn J, Prisic S, Kutateladze TG, Vakoc CR, Min J, Kingston RE, Fischle W, Warren ST, Page DC, Shi Y. (2014). Achromatin-dependent role of the fragile X mental retardation protein FMRP in the DNA damage response. Cell 157, 869-881.

  10. Qi HH, Sarkissian M, Hu GQ, Wang Z, Bhattacharjee A, Gordon DB, Gonzales M, Lan F, Ongusaha PP, Huarte M, Yaghi NK, Lim H, Garcia BA, Brizuela L, Zhao K, Roberts, TM*, and Shi, Y*. (2010). Histone H4K20/H3K9 demethylase PHF8 regulates zebrafish brain and craniofacial development. Nature 466, 503-507. (* Co-Correspondence)

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